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咨询信息

我们的产品覆盖了化学信息学,生物信息学,以及实验室信息管理
针对您的研究需求

我们为您选择最适合您的产品
上传时间:2016-06-23 14:52:11

药物研发信息管理平台的建立
——建立企业级研发数据的收集、管理、共享平台
药物研发机构在不断开展科研工作的进程中,会不断产生并收集大量的以化合物分子为中心的科研数据,包括分析谱图数据,样品库存信息,筛选、生测数据,ADME数据,甚至临床前、临床试验数据等等。如果没有一个集中的数据管理系统,这些数据将分散在不同的部门、不同的电脑和文件中,难以获取并且容易丢失。康昱盛技术支持/开发团队基于ChemAxon先进化学信息学技术,为中国制药企业提供先进的药物研发数据库及信息管理平台的开发和实施服务。
 

Compound Registration 化合物注册系统

它帮助用户把化合物分子结构注册到化合物库。注册过程会确保库中所有化合物的唯一性。注册系统的业务规则具有可配置性,可以根据企业内部的需求来灵活定义化合物的唯一性。提交的化合物注册申请首先会经过这些注册规则的处理,对化学结构进行验证和自动修正。全程受审计的注册数据将与每个唯一的化合物存放在一起,而最大程度的减少人工处理的工作。

Biological Registration System 生物实体注册系统

BRS以生物实体信息的注册、审批、存储、检索、报告为主体,将实体注册流程自动化,保证生物实体在数据库中的唯一性,对生物实体以及相关的实验信息进行集中跟踪和管理。可注册的生物实体包括细胞系、蛋白、序列、DNA、RNA、抗体、ADC复合物等。
 

Plexus Suite:支持决策创新的药物研发信息管理平台


Plexus Suite是一个基于web,可以轻松访问、检索、显示和分析研发数据的软件包,将强大的化学智能与浏览器环境的技术优势结合起来。它致力于为虚拟化合物库设计、化学/文本数据挖掘、数据分析和数据库管理提供广泛的解决方案,是个多功能的平台,可以适用于从小的生物技术初创企业到大的制药公司的各种工作流程。
Plexus Suite包含了多种工具,最主要的数据检索和浏览工具是Plexus Connect,其他工具则为Plexus Connect增加不同的化学智能功能。目前Plexus Suite包含Plexus Connect, Plexus Design和Plexus Mining三个组件。

Connect

Plexus Suite中研发人员用于访问、检索和浏览科研数据的用户界面。它提供了多用户并发通过Web访问企业研发中心数据库的途径。在Connect中用户可以查询化学结构和各种数据,并对查询结果进行浏览、排序、保存,创建检索条件并进行保存等。

Design

Plexus Suite中的虚拟化合物库设计解决方案。通过简单的几步便可基于分子骨架或者反应枚举生成具有合成意义的虚拟化合物库。Plexus Design提供一系列的通过理化性质来区分化合物特征的功能,帮助用户了解所生成的化合物库。

Mining

Plexus Mining是一个与化学智能检索相结合的独特的化学信息挖掘解决方案。它通过ChemAxon成熟的化合物命名技术,可以从任何类型的文档中提举化学信息,例如各种格式的化合物名称,内嵌的化学结构等。

支持药物研发信息管理平台开发的各种专业工具

Marvin Applets

包括Marvin Sketch, MarvinSpace, MarvinView三个组件,可以支持网页上调用MarvinSketch画图工具绘制化学结构式或者反应式,并通过MarvinView在网页上显示化学结构式,通过MarvinSpace显示并操作3D化学结构。

Marvin JS

是将MarvinSketch的化学智能与基于JavaScript的浏览器技术进行结合的艺术级化学绘图工具。这是一个轻便、快如闪电、且不受操作系统影响的化学绘图工具,可以在各种主流的浏览器上运行,而不用运行Java插件,避免了Java启动慢的问题,为在WEB环境中绘制和修改标准的化学结构式、反应式和提问分子结构提供了强大的解决方案。

JChem Base

是开发具有化学结构的存储、检索功能的应用程序的工具。它可以处理分子结构,反应式,聚合物,Markush和提问化学结构等数据内容。JChem Base可与各种数据库(Oracle, MS SQL Server, DB2, Access等)整合,提供快速的子结构检索、相似性结构检索、精确结构检索、超结构检索和其他的检索功能。

JChem Oracle Cartridge

通过Oracle本地的SQL语言为Oracle平台增加了化学智能,让用户可以灵活有效的方式基于SQL平台使用JChem Base丰富的管理和检索化学数据库的功能。

JChem PostgreSQL Cartridge

是一个易于实施的化学数据库管理和检索引擎。它使用本地SQL语言运行在PostgreSQL关系型数据库上,是与JChem Oracle Cartridge并列的一个处理化学数据集的高信价比解决方案。它所具有的可拓展性可以管理从个人到组,甚至到企业级别的数据。

Markush技术组件包

Markush结构,或者说广义化学结构,广泛用于在组合库和化学专利中定义大的化学结构空间。ChemAxon提供最先进的Markush技术,包括在Markush结构空间进行快速结构检索,化学结构枚举,化合物库重叠分析,自动Markush解析。所有Markuch分析功能都作为ChemAxon的JChem技术的拓展功能进行调用,包括JChem Base, JChem Cartridge, Instant JChem等。

Instant JChem

科学家连接并访问企业中心数据库,查询、浏览化学结构以及相关科研数据的客户端应用程序。Instant JChem允许用户同时打开并管理多个数据库。除了简单的化学结构,用户还可以在数据库中存放或检索相关的数据、化学反应,甚至是Markush结构。支持数据的相互关联,因此Instant JChem是管理和报告化学和生测数据的十分便捷的工具。Instant JChem具有一系列丰富的功能,包括可定制的数据库视图,整合化合物库枚举功能、化合物属性字段的生成,分子描述符与预测数据的生成等。

基于JChem Cartridge的研发信息管理平台开发框架

这是个分为两层的开发框架。底层是Oracle或者PostpreSQL数据库和JChem Cartridge服务器。JChem Cartridge的主要功能是支持在Oracle中通过本地SQL语言来添加、操作、检索和管理化学结构。它的化学智能来源于ChemAxon的核心Java库。Oracle通过调用在与Oracle RDBMS整合的特定的JRE环境中运行的Java存储过程来使用已有的Java库。为了提高运行性能,JChem Cartridge通过一个外部JRE环境—JChem服务器—来运行高性能计算功能。
在JChem Cartridge技术的支持下,开发人员可以运用通用标准的开发技术,如java, .NET, SQL等,来进行应用界面的开发,而不需要额外学习处理化学结构的任何技术。
 

基于JChem Base的研发信息管理平台开发框架

基于JChem Base的开发框架可以支持更多类型的数据库,如MySQL, SQL Server, DB2等。与基于JChem Cartridge的开发框架不同的地方是此时不能通过SQL脚本来处理化学结构,对化学结构的任何操作都通过从应用界面调用JChem Base类库中的函数来实现。
 

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