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  • 服务介绍 通过生物学研究确定药物靶标(生物大分子)之后,一个亟需回答的问题是:如何从靶标结构出发,发现或设计出一类小分子化合物与之结合从而改变其生物学活性?虚拟药物筛选即是解决此类问题的重要手段之一。 确定靶标的三维结构对于基于结构的药物设计非常重要。通常情况下,研究者可以搜索PDB数据库(http://www.pdb.org)查找通过X-Ray衍射或是NMR方法测定的三维结构。然而在某些情况下,例如分子量很大的膜蛋白,难以通过结晶方法得到高质量的晶体,从而使得测定其晶体结构变为不可能。在此种情况下,同源建模可以用来构建靶标的三维结构。如果能对未知结构蛋白寻找到一个同源模版,就可以在计算机中构建其高精度的三维结构预测模型。 获得靶点蛋白三维结构是虚拟筛选项目的起点。然而蛋白表面的拓扑非常复杂,物理化学性质
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